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FRET新助力,肽和寡核苷酸荧光标记工具

发布者:酷游ku119网址 科技    发布时间:2020-08-12     
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       前情回顾:

 

 

      荧光染料标记的肽和寡核苷酸是生化和细胞研究中的重要工具,目前荧光肽和寡核苷酸已广泛用于所有主要类型的荧光成像中,包括荧光共振能量转移(FRET),这些标记的生物分子被广泛用于基于分子信标和其他技术的传染病诊断。FRET肽和寡核苷酸也已通过荧光相关细胞分选(FACS)用于细胞分析,用于体内或体外的研究和诊断目的。

    

       肽和蛋白质分子量计算器:

 

       为了帮助您计算寡肽和蛋白的分子量,请使用我们的在线计算器,//www.aatbio.com/tools/calculate-peptide-and-protein-molecular-weight-mw

 

       用于荧光标记染料

 

      根据肽/寡核苷酸的序列,可以通过共价键将荧光染料在特定点连接至肽/寡核苷酸。染料和肽/寡核苷酸之间的连接是共价键,在大多数生物学条件下较稳定且不会被破坏。在某些情况下,在染料和肽/寡核苷酸之间引入功能性接头来使肽/寡核苷酸生物活性改变最小,对于所有的肽/寡核苷酸标记,染料都必须连接在确定的位置。通常,优选的荧光标记应具有高的荧光量子产率并保留未标记生物分子的生物学活性。

 

      我们为大家提供了多种类型荧光标记染料,便于染料与用于生物学研究的肽/寡核苷酸的结合,这些荧光染料包括香豆素荧光素罗丹明花青素,其中,我们的Tide Fluor™,California Red™,SunRed™和Helix Fluor™染料经过优化,可标记肽和寡核苷酸。

 

       花青染料家族和其他经典染料

 

花青素染料家族

 

      图1.将 HeLa细胞与tubulin抗体孵育,然后与Cy5®山羊抗小鼠IgG偶联物(红色)一起孵育。细胞核用Hoechst 33342(蓝色,Cat# 17530)染色。

 

      尽管现代染料(例如iFluor™染料)通常用于更具挑战性的生物学应用,但经典的荧光标记染料有时因其较低的成本而非常适用于某些要求不高的应用。在经典的标记染料中,cyanines是最受欢迎的选择之一,其他染料包括FAM,TAMRA和TexasRed®,也都可以用于偶联肽和寡核苷酸。

 

       花青素染料家族和其他用于荧光标记染料的经典染料:

 

花青染料 激光 Ex / Em(nm) 滤光片组 消光系数(ε) 量子产率(Φ)
532 nm 554/568 nm Cy3 / TRITC 150,000 0.15
633-647 nm 650/669 nm Cy5 250,000 0.27
730 nm 754/778 nm Cy7 250,000 0.3

 

       Tide Fluor™系列染料


      Tide Fluor™染料经过优化,可作为开发FRET寡核苷酸和肽的基础,我们的Tide Fluor™染料比香豆素,荧光素,罗丹明和花青素等经典标记染料具有更强的荧光,更高的光稳定性。

 

Tide Fluor™系列染料

 

       用于荧光标记的Tide Fluor™系列染料

 

贴标染料 Ex(nm) Em(nm) 消光系数(ε) 量子产率 CF260 CF280
Tide Fluor™1 345 442 20000 0.95 0.246 0.187
Tide Fluor™2WS 502 525 75000 0.9 0.211 0.091
Tide Fluor™2 500 527 75000 0.9 0.288 0.201
Tide Fluor™3WS 555 565 150000 0.105 0.079 0.079
Tide Fluor™3 555 584 85000 0.85 0.331 0.201
Tide Fluor™4 590 618 90000 0.91 0.489 0.436
Tide Fluor™5WS 649 664 250000 0.25 0.023 0.027
Tide Fluor™6WS 676 695 220000 0.18 0.111 0.009
Tide Fluor™7WS 749 775 275000 0.12 0.009 0.049
Tide Fluor™8WS 775 807 250000 0.08 0.103 0.109

 

     CF260是染料在260 nm处的校正因子,用于消除染料对260 nm处的吸光度的影响(用于寡核苷酸和核酸标记)

     CF280是染料280 nm处的校正因子,用于消除染料对280 nm处的吸光度的影响(用于肽和蛋白质标记)

 

       其他系列染料

 

     我们的California Red™,Sunnyvale Red™和Helix Fluor™染料非常适合对寡核苷酸和肽进行强大,高效的标记。这些系列具有改进的性能和亮度,仍然与传统的荧光标记染料(例如FAM,TET,VIC,JOE,NED,TAMRA和ROX)检测平台兼容。

 

       其他荧光标记系列染料:

 

货号 产品名称 Ex(nm) Em(nm) 规格
250 Helix Fluor™545,琥珀酰亚胺酯 525 545 1mg
251 Helix Fluor™575,琥珀酰亚胺酯 546 575 1mg
394 Sunnyvale Red™SE *替代6-ROX * 576 605 5mg
473 California Red™ SE 583 603 5mg
479 California Red™ SE 583 603 1mg

 

       不用于荧光标记染料

 

      蛋白酶参与许多生理过程, 蛋白酶的检测和特定蛋白酶抑制剂的筛选对于发现用于治疗和管理蛋白酶相关疾病的潜在药物至关重要,各种供体和受体分子(荧光的或非荧光的)附着在肽/蛋白质上(形成内部淬灭的结合物),并根据氨基酸序列用于检测蛋白酶。精心选择供体和受体分子,使受体的激发波长与供体发射波长重叠,从而确保荧光通过共振能量转移而淬灭,底物的酶水解导致供体和受体分子的空间分离,从而恢复供体荧光。

 

       FRET原理

 

      荧光共振能量转移(FRET)是一种物理现象,在生物医学研究和药物发现中已经越来越流行。FRET是能量从供体分子(donor)到受体分子(acceptor)的无热量传输。供体分子是最初吸收能量的荧光基团,而受体是随后转移能量的荧光基团,这种共振相互作用发生在大于原子间的距离上,而没有转化为热能并且没有任何分子碰撞。能量转移导致供体的荧光强度和激发态寿命的减少,以及受体的发射强度的增加。以发生FRET的方式相互作用的一对分子通常称为供体/受体对。由于它对距离敏感,FRET被用于观察分子间相互作用。

 

荧光共振能量转移

      图2. 从供体到受体分子的FRET过程图。水平线代表每个分子的离散电子能级。能级被标记为单峰态(S)或三重态(T),其下标分别为0,1或2(分别代表基态,第一激发态或第二激发态)。分子的电子通常处于基态S0。电子可以通过许多过程被激发到更高的能级,包括光吸收和化学反应。

 

      尽管有很多影响FRET的因素,但要使FRET发生需要满足的主要条件相对较少:

      供体和受体分子必须彼此接近(通常为10-100Å)

      受体的激发光谱必须与供体的发射光谱重叠。它们重叠的程度称为光谱重叠积分(J)

      供体和受体过渡偶极的方向必须近似平行

 

      假设供体受体对是相匹配的,发生FRET所必需的最关键元素是供体受体对之间的紧密接近。Förster证明了过程(E)的效率取决于供体与受体之间距离的六次方的倒数,如以下等式所示:

 

 

E = R o 6 /(R o 6 + r 6

 

 

      其中Ro是能量传递一半时的Förster距离,r是供体与受体之间的实际距离。Ro的大小取决于体与受体的光谱性质。Förster距离在20到90Å之间时,对研究生物大分子最有用。

 

       Tide Quencher™系列

 

      尽管DABCYL已被用于开发各种FRET应用,但对于较长波长的染料(例如荧光素,罗丹明和花青素)的淬灭效率较低,限制了其在敏感的荧光FRET探针开发中的应用。另外,DABCYL的吸收光谱对环境敏感。我们已开发出耐用的Tide Quencher™受体染料,用于研发更长波长的FRET探针,Tide Quencher™染料是消除经典淬灭剂限制的绝佳选择。

 

Tide Quencher™

      Tide Quencher™染料的主要优点:

      探索其他淬灭剂可能无法实现的FRET潜力

      多种反应形式便于自我构建所需的FRET生物分子

      与您所需的荧光供体完全匹配

      性价比高

 

       Tide Quencher™系列产品:

 

淬灭剂 激发(nm) 消光系数(ε) CF260 CF280
488 20,000 0.147 0.194
512 21,000 0.100 0.120
515 21,000 0.100 0.120
576 22,000 0.085 0.091
576 90,000 0.186 0.205
604 23,000 0.146 0.183
604 90,000 0.149 0.136
661 24,000 0.170 0.082
661 130,000 0.072 0.082
691 130,000 0.120 0.102

 

      CF260是染料在260 nm处的校正因子,用于消除染料对260 nm处的吸光度的影响(用于寡核苷酸和核酸标记)

      CF280是染料280 nm处的校正因子,用于消除染料对280 nm处的吸光度的影响(用于肽和蛋白质标记)

 

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